故事緊接《生化危機5：懲罰》，在華盛頓特區愛麗絲被威斯克背叛后人類幾乎要失去最后的希望。作為唯一的幸存者，也是人類對抗僵尸大軍的最后防線，愛麗絲必須回到噩夢開始的地方——浣熊市。在那里雨傘公司正在集結所有的力量企圖對殘余的幸存者發起最后的打擊。 在和時間賽跑的過程中，愛麗絲將和昔日的朋友一起對抗僵尸和最新變種怪物。愛麗絲失去了自己的超能力，加上雨傘公司的瘋狂進攻，這將是她拯救人類以來打得最艱難的一仗。